本校は創立１１７年目を迎える、国内屈指の歴史・伝統と実績をもつ、日本で唯一の離島における水産単科の高等学校です。本年度は「地域を愛し、地域に愛されつつ、未来を切り拓く海洋スペシャリストの育成」を教育目標に掲げ、Localist（地域人材）の育成、Specialist（専門人材）の育成、Rich Humanity（豊かな人間性）を備えた人材の育成を目指し、離島という特色ある環境の中で、他の高校では絶対にできない様々な授業や実習、資格取得などを通して、海に親しみ、海を知り、海を愛し、海を拓く（利用する）学習を推進し、水産・海洋の夢と未知なるものへの挑戦心を培う教育を行っています。
　日本には約６５００の高等学校（通信制を除く）がありますが、そのうち水産海洋系高校はわずかに４６校、生徒数の割合は、高校生全体の０．３％にも満たないものです。しかし、そのわずかな生徒たちが、他のどの高校でも行われていない極めて専門的な水産海洋教育を経て、海洋国家日本の商船や水産などの産業や経済のみならず、資源、エネルギー、環境、海上防衛保安といった分野を支える「柱」を担っています。

　隠岐水産高校の生徒は、地域課題解決に貢献しています。例えば、実習で身に付けた工作機械の使い方や溶接技術を活用し、福祉サービス施設の農園に自作の作業台を提供したり、栽培研究を有効活用し、磯焼け(海藻が育たなくなる現象)海域に校内で繁殖させたアラメを移植し、藻場の再生活動を行ったり、地域貢献を通して地域の方々とつながりを作り学びを深めています。貢献することは自己有用感の向上だけでなく、「次はもっとこうしてあげたい！」と、さらなる学びの意欲につながっていきます。また隠岐諸島は、2013年(平成25年)9月9日、世界ユネスコジオパークに認定されました。 ジオパークとは、地球科学的な価値のある遺産を持ち、教育などに利用しながら持続可能な開発を進めることを認定された地域のことを指します。何億年も続いている「大地の成り立ち」、その大地の上に育まれた「独自の生態系」、今日まで受け継がれてきた「人の営み」を、ひとつの物語として知ることができる、日本にたった9ヶ所しかない貴重な地域です。

　隠岐水産高校の寮は、二人部屋にしています。 　一年生は、県外や島外から親元を離れた初めての生活です。本人が気付かずとも、その不安は計り知れません。そのため最初は、「出身地が近い」「趣味が同じ」などの先輩と、合い部屋にしています。 寝食を共にするため先輩とはすぐに馴染み、敬語で話す友達のような存在になっていきます。さらに多くの先輩と関係性をつくるため、年に4回ほど部屋替えを行います。そのたびに信頼できる先輩が増え、学校への安心感も増し、より楽しい学校生活が広がっていきます。 　二年生になると、今度は一年生を受け入れる立場になります。一対一で後輩と向き合うこの経験は、生徒には大きな成長をもたらしてくれます。 ※ 万一、不都合が生じた場合にも、部屋替えを行います。